如何使用bioconductor docker来debug程序中的错误

在package的维护过程中,我们常常遇到的一个困难就是无法重复bioconductor build系统中的错 ...

Bioconductor所有包的网络图(software Package Network)

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生成此图,为了方便大家了解Bioconductor的包中,哪些包是最重要的,哪些包是首先要学习的,以及包与包之 ...

再论热图 (heatmap) 3

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“`{r echo=FALSE,warning=FALSE,message=FALSE} libr ...

3D plot genomic tracks

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依照大多数人的观点,使用3D表示genomic tracks并不是一个很好的选择,因为会使图象变得复杂难懂,难 ...

Rsamtools基础知识问答 4

在次世代测序结果中,我们经常需要对bam/sam文件进行操作。在命令行中,我们很习惯使用samtools来操作 ...

IUPAC strings to pcm

需要把IUPAC字符串形式的motif转换成position count matrix “`{r} ...

如何获取venn diagram中的基因列表

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“`{r echo=FALSE,warning=FALSE,message=FALSE} libr ...

MeSH分析

在2013年,MeSH ORA framework在Bioconductor发布了。它很恐怖的一次性发布了12 ...

R控制绘图区域颜色 4

R控制绘图区域颜色
今天遇到一个有意思的问题,有人问我,如何生成一个黑白反转的图。 在R中,默认的图都是墨白的。咋弄呢? 其实很简 ...

cbioportal的CGDS-R库使用介绍

今天要介绍的这个包是[cBio Cancer Genomics Portal](http://www.cbio ...